Resumen de lo mejor de la primera temporada & al final se anuncia 2da temporada para el 2014.
Kirito y el resto decide lanzarse a una misión acuática dentro del mundo de ALO para que Yui pueda cumplir su deseo de ver una ballena. Mientras se preparan para partir, descubren algo que les deja impactados... a Leafa, o Suguha, le da miedo el agua. Con ello, Asuna y el resto de chicas del grupo deciden enseñar a Suguha a nadar en una piscina en el mundo real. Mientras tanto, Kirito se encuentra con alguien...

La primavera marca el inicio de otro nuevo año escolar en la escuela en Kamakura.
Un nuevo estudiante es transferido, Ryoichi Kyogoku se une al octavo grado. Kyogoku tiene una muy alta habilidad en telepatía y su padre le ha ordenado usar esta habilidad para dominar la mente de los demás y apoderarse de la escuela. Él instantáneamente gana popularidad en la escuela gracias a su apariencia y su carisma y se propone a apoderarse de la escuela. Mientras la mayoría de la gente de la escuela ha caído completamente bajo el control de Kyogoku solo un muchacho parece ser inmune a esto, Seki. ¿podrá Seki salvar a todos del control mental? (fuente: Scotland Loves Animation)

En la era Heisei 20+, por los alrededores del Sagrado Monte Fuji, se encuentra una gigantesca escuela. En la Academia Privada Buou, todos los estudiantes son hijos de Samurai y mientras cumplen con sus estudios, deben pasar dias preparándose para algún día luchar en batallas que pondrán en riesgo sus vidas. A pesar de la pacífica fachada de la escuela, muchos conflictos internos se desatan dentro de ella. Aquellos que se rebelan contra el Régimen Tokugawa y la Facción Toyotomi, un grupo de cazadores al servicio del tirano consejo estudiantil.

La historia gira en torno de Kyouhei, un estudiante de universidad que creció en una remota villa que adora a una especie de robots, de nombre kukuri, como si fueran dioses. Kyouhei toma la decisión lógica de todo habitante de pueblos como Silent Hill o Hinamizawa, se muda lejos, concretamente a Tokyo y se olvida de su vida anterior. Sin embargo, se encuentra con su hermana menor Utao y su kukuri en Tokyo. Ella está ahí para avisarle sobre un fugitivo de nombre Aki y quien junto a su propio kukuri, es el culpable de un horripilante crimen que Kyōhei acaba de presenciar. Evidentemente, se da cuenta que no puede escapar de las tradiciones de su villa.

La segunda temporada se centrará en el arco de "Las Hermanas". Tomando como referencia un único volumen de las novelas ligeras Toaru Majutsu , que a su vez se amplió en gran medida en el manga de Toaru Kagaku no Railgun.
El arco se centra en las terribles experiencias de Mikoto Misaka después de descubrir la existencia de las hermanas que a través de un ruido de radio estaban siendo utilizadas en el "Shift nivel 6" , un experimento en el que se asesinan entre sí, para que el mayor nivel, es decir 5, aceleré su evolución, pudiendo alcanzar el nivel 6 rápidamente.

Yumeji Fujiwara es un joven estudiante que gracias a un evento ocurrido hace 10 años, tiene el poder de ver el aura de los sueños de otras personas, siendo capaz de predecir qué tipo de sueño tendrán la noche siguiente. Desde entonces, siempre ha soñado que unos gatos callejeros lo persiguen, aparentemente por orden de un misterioso hombre enmascarado. Un día, cuando estaba a punto de volver a casa después de su día escolar, se encuentra con una misteriosa chica, llamada Merry Nightmare, que es en realidad un demonio de los sueños que busca una manera de volver a su mundo natal. Tras pensarlo, Yumeji decide ayudar a Merry a regresar a su mundo, sin percatarse que esto lo llevaría a vivir extraños sucesos relacionados con el mundo de los sueños.

Tras un largo y complicado viaje, el héroe llega finalmente al castillo de Maou, la señora oscura, solo para descubrir que le piden ayuda. El héroe explica que la guerra que los demonios han provocado con los humanos ya ha matado a miles de personas y ha dejado a aun más en la miseria. La reina de los demonios sin embargo le responde que gracias a la guerra, la sociedad humana ha podido unirse más y le muestra pruebas de que ha incrementado la población, la producción, potenciado la economía y mejorado la soeicedad en general. Y lo que es más, según ella, acabar con la guerra derivaría en una guerra civil que produciría aun más derramamientos de sangre. El héroe, convencido de que la única forma de alcanzar la “paz” por decirlo de alguna manera, es unirse a la señora oscura, decide aliarse con ella.