Banri Tada es un estudiante recién admitido a una facultad de derecho en Tokio, que ha perdido sus recuerdos por haber caído accidentalmente de un puente poco después de graduarse de la preparatoria. En el momento del accidente, su alma escapó de su cuerpo, llevándose sus recuerdos anteriores a su graduación.
Luego de la ceremonia de entrada a la facultad, Banri se pierde en el campus intentando buscar la sala de orientación de primer año, y en su camino conoce a Mitsuo Yanagisawa, que también se había perdido buscando dicha sala. De algún modo logran llegar a tiempo y se encuentran con una chica llevando un ramo de rosas, con el que golpea a Mitsuo en la cara. Esa chica tan perfecta es Koko Kaga, la amiga de la infancia de Mitsuo, con quien había prometido casarse al ser mayores. Para poder escapar de dicha promesa, Mitsuo había tomado en secreto el examen de ingreso a la facultad, pero Koko al enterarse hizo lo mismo con tal de estar con él.

La Tierra es invadida por seres extra-dimensionales, conocidos como “Los Nova”. Kazuya perdió a su hermana en la guerra que se desató contra estos seres, y decide enrolarse en Genetics, una academia militar donde se entrena a las guerreras conocidas como Pandoras, quienes, mediante la implantación en sus cuerpos de un tejido conocido como Stigmata, adquieren las habilidades necesarias para combatir a los invasores. Pero, no pueden combatir solas, necesitan una pareja, un chico joven llamado Limiter, que evite el efecto de “Freezing” (Congelamiento, del espacio-tiempo en este caso) que es lo que sucede siempre que los Nova aparecen. Kazuya terminará siendo el compañero de Bridget L. Satellizer, conocida como “La Reina Intocable”, ya que por su ferocidad y carácter insoportable, es la única Pandora que jamás ha sido capaz de tener una pareja estable. Juntos, se ayudarán mutuamente para tratar de sanar las heridas del pasado.

La película termina cuando Saya ya convertida en una humana completa, camina en una carretera y allí se ve su ojo derecho como parte Furukimono, debido como parte del acuerdo por cumplir su deseo solo su ojo derecho es lo unico que le queda de parte Furukimono, Saya empieza a recordar a sus amistades que tuvo y que se perdieron durante la batalla contra Fumito y su legion de "Los Antiguos". Más tarde un e-mail anónimo enviado a una central de periódicos por Hiro, abren la información sobre los propósitos y los involucrados en donde ellos están Fumito y Yuuka Amino.

Sakamoto Ryuuta es un desempleado de 22 años de edad que vive con su madre. En el mundo real, puede que no tenga nada especial, pero online, es uno de los mejores jugadores del mundo del juego de combate "BTOOOM". Un día, se despierta en lo que parece ser una isla tropical, aunque él no recuerda nada de cómo o por qué ha llegado hasta ahí. Desplazándose por la isla, Ryuuta ve a alguien y pide ayuda. El extraño responde lanzándole una bomba, entonces Ryuuta se da cuenta de que su vida está en peligro, y que de alguna manera ha quedado atrapado en una versión real de su juego favorito.

Saubure 1924, un lugar (ficticio por cierto, pero es una combinacion de los paises que supuestamente lo rodean)  y epoca donde están de moda las historias de fantasmas, en la academia de "Santa Margarita" llega un alumno japonés: Kujo Kazuya,  el apodado y tambien temido "Dios de la muerte", y por ende carece de amistades en la academia, puesto que su simple compañia implica un mal augurio..
Como es un recien llegado, se pone a dar un recorrido por la escuela para conocerla, puesto que es muy grande y misteriosa; en su rondín llega al edificio de la Biblioteca, una solitaria y alta torre, que posee su propia historia, puesto que se dice que en lo más alto de la torre yace una hada de exquisita belleza y de largo cabello dorado, y que a cambio de un alma responderá cualquier pregunta que le hagan.

Un hermoso cuento de hadas que se pasea por la tierra y el mar. Hikari Sakishima y Manaka Mukaido son habitantes del mar y amigos de la infancia. Cuando su escuela en el mar está cerrado se ven obligados a asistir a uno de una tierra, pero debido a un encuentro especial, sus vidas adquieren un nuevo giro.

Un slice of life protagonizado por cuatro chicas: Natsumi, Saki, Yuka y Rinko, durante el verano viviran un milagro que cambiará para siempre sus rutinarias vidas.